著書（日本語のもののみ）

• 現代数理科学事典（著者として），丸善，近日刊行予定.
• Neil C.Jones，Pavel A.Pevzner著, 渋谷哲朗・坂内英夫　訳,　バイオインフォマティクスのためのアルゴリズム入門,共立出版，2007年6月.
• 日本バイオインフォマティクス学会（編），バイオインフォマティクス事典（分野別担当者、閲読者、執筆者として），共立出版，2006年７月
• 渋谷哲朗，バイオインフォマティクスにおけるデータマイニングの基礎，ゲノム研究実験ハンドブック，辻本豪三、田中利夫（編），羊土社，２００４年１０月，pp. 45-48．

解説記事・招待論文（日本語のもののみ）

• 渋谷哲朗，バイオインフォマティクスの現状と課題，電子情報通信学会誌， vol. 90, no. 2,，2007年2月，pp. 145-147.
• 渋谷哲朗，ＢＤＧＦ法による遺伝子同定　―大規模モチーフ辞書を用いて―，バイオベンチャー，vol. 2, no. 6, 2002年11月，pp. 86-89.

招待講演・セミナー（日本語のもののみ）

• 渋谷哲朗、A New Algorithm Design Framework for Searching Protein 3-D Structures, GCOE (ゲノム情報ビッグバンから読み解く生命圏) 特別講演, 2010.
• 渋谷哲朗，「タンパク質立体構造と組み合わせパタンマッチング」， 第68回 人工知能基本問題研究会 (SIG-FPAI).，2008年.
• 渋谷哲朗，「検索技術と遺伝子発見への応用」，第24回生命情報科学特別講義，産業総合研究所生命情報科学センター，2002年．
• 渋谷哲朗，ゲノム情報処理における検索技術の応用，第１４回RAMPシンポジウム，2002年.
• 渋谷哲朗，大規模データベースにおけるパタン発見とマイニング，国際バイオＥＸＰＯ、2002年.
• 渋谷哲朗，New Approaches to Flexible Alignment of Multiple Biological Sequences, Combinatorial Optimization Seminar: Theory and Applications (COSTA), 97-4, Kanagawa, October 25, 1997.

特許

• 特許公開2005−157500 解析装置、解析方法、プログラム、及び記録媒体
• 特許公開2004−259119 塩基配列のスクリーニングを行うためのコンピュータ・システム、そのための方法、該方法をコンピュータに対して実行させるためのプログラムおよび該プログラムを記憶したコンピュータ可読な記録媒体
• 特許公開2003−345805 塩基配列のクラスタ生成システム、塩基配列のクラスタ生成方法、該クラスタ生成方法を実行するためのプログラム、および該プログラムを記憶したコンピュータ可読な記録媒体、および塩基配列情報提供システム
• 特許公開2002−351908 データベース検索装置、データベース検索システム、データベース検索方法、プログラム及び記憶媒体
• 特許公開2002−229987 パターン検索方法、パターン検索装置、コンピュータプログラム及び記憶媒体
• United States Patent 20020173918, System and method for identifying genes
• 特許公開2001−188791 配列の変換方法、構造解析方法、装置、記録媒体及び伝送媒体
• 特許公開２０００−７６３３２ 複数サーバ間送信数最適化システムおよびその方法
• 特許公開平11−184837 最短経路探索システム
• 特許公開平09−133540 複数経路取得方法及びこの方法を用いた車載ナビゲーション装置

新聞記事

• 東京大学新聞、新仕様スパコン、2006/10/10
• 日経産業新聞、医療バイオR&D, 日本ＩＢＭ東京基礎研（下）、2003/5/28
• 日経産業新聞、医療バイオR&D, 日本ＩＢＭ東京基礎研（上）、2003/5/27
• 化学工業新聞、遺伝子解析で共同研究、日本IBMと理研、2003/5/7
• ZD-Net、日本IBMと理研、バイオインフォマティクス分野で共同研究、2003/5/7
• 日経産業新聞、光熱菌ゲノム解析、2003/5/6.

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Last updated: 14 June, 2007