MultiQC ======== | Fastqc, PARABRICKS BAMMETRICS, CollectMultipleMetrics(Picard)の結果を | multiqc_report.htmlファイルとして出力します。 | | multiqc_report.htmlファイルはhtml ファイルなのでダウンロードしてブラウザで開いてみてください。 ( :ref:`scp` ) | | MultiQCについては https://multiqc.info/ を見てください。 .. note:: **General Statistics** | このパイプラインでは以下の点についてMultiQC v1.13.dev0を改変しています。 * PCT_EXC_DUPEの表示(% DUP) * Median Coverageを非表示にしてMean Coverageを表示 * ID: SD_COVERAGEのColumnをMedian CoverageからSD Coverageに変更 * TOTAL_READSとPF_READS_ALIGNEDの表示