RNA 解析で出力されるファイルについて
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STAR, STAR-Fusion, Htseq, Deseq2, Fastqcの出力結果がそれぞれのフォルダに出力されます。

出力ディレクトリ階層
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.. code-block:: bash
  :caption: RNA解析結果
  
  {出力先ディレクトリ}
    └star/                             ：1) STAR結果
        └{サンプル名}
            └{サンプル名}.Aligned.sortedByCoord.out.bam
            └{サンプル名}.Aligned.sortedByCoord.out.bam.bai

    └fusion/                           ：2) STAR-Fusion結果
        └{サンプル名}/
            └star-fusion.fusion_predictions.abridged.tsv
            └star-fusion.fusion_predictions.tsv

    └expression/
        └htseq/                        ：3) htseq-count結果
            └{サンプル名}/
                └{サンプル名}.count.txt

        └deseq2/                       ：4) deseq2結果
            └{tumor_panel名}_{normal_panel名}/
                └gene_clustering.png
                └heatmap1.png

    └genomon_fusion/                   ：5) Genomon Fusion結果
        └{サンプル名}/
            └{サンプル名}.genomonFusion.result.txt
            └{サンプル名}.genomonFusion.result.filt.txt

    └genomon_expression/               ：6) Genomon Expression結果
        └{サンプル名}/
            └{サンプル名}.genomonExpression.result.txt                       
     
    └fastqc/                           ：7) fastqc結果
        └'index.html'

    └config/                           ：8) Other
    └log/
    └work/