List of Japanese Publications

中井謙太・金久實, コンピュータによる配列解析 -- IDEAS への招待 --, 内田久雄編　核酸・蛋白質の構造情報 東京大学出版会 181-227 (1989).

中井謙太, 蛋白質の細胞内ターゲティングシグナル, RADIOISOTOPES 41, 67 (1992).

中井謙太, 遺伝子情報処理システムとしての生命, 信学技報 NLP92-28, 35-42 (1992).

中井謙太, 蛋白質のデータ・知識ベースによる機能予測, CICSJ Bull. 11, 18-21 (1993).

中井謙太, 遺伝子スイッチのコントロール, bit 25, 86-94 (1993).

中井謙太, 遺伝子スイッチのコントロール, 星田昌紀編　遺伝子情報処理への挑戦：コンピュータとバイオのフュージョン, 共立出版 65-79 (1994).

中井謙太, 基生研におけるネットワーク利用環境について, 法橋尚宏・丸山和夫編　医学・分子生物学のための Macintosh ハンドブック２： もっと知りたいデータ解析・論文投稿・スライド作成 羊土社 151 (1994).

中村春木・中井謙太, バイオテクノロジーのためのコンピュータ入門, コロナ社, 302 頁 (1995).

中井謙太・高木利久, ゲノム研究とインターネット, 石田晴久・後藤滋樹編　インターネットの使い方, bit 別冊 pp.192-197 (1995).

中井謙太, タンパク質局在部位予測システム PSORT：最近の進歩, CBI News 15, 3-4 (1996).

中井謙太, ネットワークでの配列解析, 化学と生物 34(3), 185-191 (1996).

中井謙太, Pedro コレクション（in 連載　インターネット活用術）, 実験医学 14(7), 977-978 (1996).

中井謙太・藤渕航, インターネットを利用した遺伝情報検索システム最前線, 薬学図書館 41,(4) 359-364 (1996).

中井謙太, 細胞内局在化の知識ベースシステム, 日本生物物理学会 シリーズ・ニューバイオフィジックス刊行委員会編 　ヒューマンゲノム計画（シリーズ　ニューバイオフィジックス11）, 　共立出版 160-173 (1997).

中井謙太, ゲノム機能予測における知識ベースアプローチ, 榊、金久、中村、大木、小原、高木編　ゲノムサイエンス：生命の全体像の 解明をめざして, 蛋白質核酸酵素増刊号, 42(17), 3001-3007 (1997).

中井謙太, ゲノムデータベースを使いこなす (in 連載 データベース・ホームページ 活用ガイド）, 実験医学 16(2), 185-188 (1998).

中井謙太, ゲノム配列データ解析における最近の進歩, CICSJ Bull. 16(1), 6-9 (1998).

中井謙太, アミノ酸配列の機能解析（in 連載講座 Bioinformatics 入門）, 化学と生物 36(6), 408-413 (1998).

中井謙太, ゲノム情報解析入門（金久・中井編 特集「ゲノム情報から生命の原理を探る」）, bit 31(6), 3-7 (1999).

中井謙太, 微生物ゲノム情報のコンピュータ解析, 生物工学会誌 77(9), 390-393 (1999).

中井謙太, トランスクリプトームインフォマティクス, 辻本豪三・田中利男編　ゲノム機能研究プロトコール （実験医学別冊 ポストゲノム時代の実験講座 1） 羊土社 121-126 (2000).

中井謙太, ゲノムインフォマティクス, 辻本豪三・田中利男編　ゲノム機能研究プロトコール （実験医学別冊 ポストゲノム時代の実験講座 1） 羊土社 163-167 (2000).

中井謙太, タンパク質の構造予測と機能予測, 遺伝子医学 4(3), 377-382 (2000).

小池麻子・石井崇洋・中井謙太, インターネットによるシークエンス解析, 綱澤進・平野久編 プロテオミクスの基礎, 講談社サイエンティフィク 55-64 (2001).

中井謙太, データベースとインターネット資源, 日本生化学会編　基礎生化学実験法 （第３巻　タンパク質 II.機能・動態解析法）, 東京化学同人 215-224 (2001).

小池麻子・中井謙太, 生物学・医学の基礎データベースと利用法, 高木利久編 ゲノム医科学と基礎からのバイオインフォマティクス, 実験医学増刊, 19(11), 1306-1315 (2001).

中井謙太, 蛋白質科学におけるバイオインフォマティクス私論, 中村・森川・鈴木・三浦編 新世紀における蛋白質科学の進展, 蛋白質核酸酵素増刊号, 46(11), 1488-1495 (2001).

中井謙太, ゲノム計画のもたらすもの, 日本生物物理学会編　新生物物理の最前線：生命のしくみはどこまで解けたか, 講談社ブルーバックス B1348, 29-56 (2001).

中井謙太, ゲノムに書き込まれたシグナル情報のコンピュータ解析, 榊・小原・大木・金久・高木・菅野・小笠原編 ゲノムサイエンスの新たなる挑戦, 蛋白質核酸酵素増刊号, 46(16), 2544-2549 (2001).

山下理宇, 中井謙太, 配列解析, 医学のあゆみ, 200(8), 581-585 (2002).

中井謙太, 200 words: バイオインフォマティクス, 医学のあゆみ, 200(13), 1230-1231 (2002).

中井謙太, アルゴリズムって何？隠れマルコフモデルって何？, 蛋白質核酸酵素, 47(10), 1332-1336 (2002).

中井謙太, 15章後半 Q&A アルゴリズムって何？隠れマルコフモデルって何？, 菅原秀明編 あなたにも役立つバイオインフォマティクス, 共立出版, 118-123 (2002).

小池麻子・中井謙太, 5章 構造予測と機能予測, 金久実編 ゲノムネットのデータベース利用法（第3版）, 共立出版, 82-101 (2002).

中尾光輝・中井謙太, PSORT, 中村保一・磯合敦・石川淳編 バイオデータベースと ウェブツールの手とり足とり活用法, 羊土社, 66-73 (2002).

中井謙太・矢田哲士, 3章 遺伝子同定・シグナル同定技術, 美宅成樹・榊佳之編　応用生命科学シリーズ 9： バイオインフォマティクス, 東京化学同人 50-84 (2003).

山下理宇・中井謙太, 第３編第１節　ゲノムのデータベース, 今中忠行監修　ゲノミクス・プロテオミクスの新展開： 生物情報の解析と応用, エヌ・ティー・エス 786-791 (2004).

中井謙太, ゲノムデータベース入門：つくる人と使う人のために, 高木利久編　東京大学生物情報科学学部教育特別プログラム： バイオインフォマティクス概論, 羊土社, 100-110 (2004).

鈴木穣、山下理宇、中井謙太、菅野純夫、 トランスクリプトーム解析とトランスクリプトームデータベベース、 小原・谷口・市川・猪飼編、バイオ高性能機器・新技術利用 マニュアル　 蛋白質核酸酵素８月号増刊 49(11), 1859-1865 (2004).

中井謙太、 遺伝子の機能予測概論、 松原謙一監修、情報生物学講義　I-配列情報の科学 財団法人国際高等研究所、55頁 (2004).

鈴木穣、橋本真一、山下理宇、中井謙太、菅野純夫, 転写開始点データベース DBTSS の構築と転写制御領域の網羅的解析、 菅野純夫編、ここまで進んだゲノム医科学と疾患研究　 実験医学増刊 23(4), 544-551 (2005).

中井謙太、法澤公寛, ゲノム解析とテラヘルツ技術, 大森豊明監修、テラヘルツテクノロジー：発生・計測・応用技術・展望, , エヌ・ティー・エス, pp.405-415 (2005).

中井謙太, ヒト遺伝子転写開始点のゲノムワイド解析, 小原・菅野・小笠原・高木・藤山・辻編集, ゲノムから生命システムへ, 蛋白質核酸酵素増刊, 50(16), p.2083 (2005).

日本バイオインフォマティクス学会編集 （編集委員会：宮野、江口、金久、高木、中井）, バイオインフォマティクス事典 pp.830, 共立出版 , (2006)
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中井謙太、 生物学の未来を考える、 蛋白質核酸酵素創刊50周年記念号 51(12), 1704-1707 (2006).

中井謙太, 第８章：バイオインフォマティクス 〜ホモロジー解析からシステム生物学まで〜, 山本雅・仙波憲太郎編、遺伝子工学集中マスター, 羊土社 pp.102-111 (2006).

蒔田由布子、中井謙太、 第２章 10. 転写因子とシスエレメントの相互作用解析に役立つ データベースとウェブツール、 礒辺・中山・伊藤編、分子間相互作用解析ハンドブック （実験ハンドブックシリーズ） 羊土社 pp.210-217 (2007).

鈴木穣、山下理宇、中井謙太、菅野純夫、 転写制御領域（プロモーター領域）の同定と解析 〜 DBTSS / TRANSFAC 〜、 中村・礒合・石川・平川・坊農編、バイオデータベースと ウェブツールの手とり足とり活用法 改訂第２版 羊土社 pp.65-75 (2007).
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ポール・ホートン、中井謙太、 PSORT（ピーソート）、 中村・礒合・石川・平川・坊農編、バイオデータベースと ウェブツールの手とり足とり活用法 改訂第２版 羊土社 pp.108-114 (2007).
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中井謙太、ポール・ホートン、 第３章 3. アミノ酸配列に基づくタンパク質の細胞内局在予測、 森下真一・阿久津達也編、実験医学増刊　生命研究へと応用と開発が進む バイオデータベースとソフトウェア最前線 羊土社 vol. 26 (7). 1106-1112 (2008) ISBN 9784758102902.
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中井謙太、 タンパク質のシステム生物学、 猪飼・伏見・卜部・上野川・中村・浜窪編、タンパク質の事典 朝倉書店 pp.575-578 (2008).

中井謙太、 第5章　ゲノムを読み解く　−バイオインフォマティクス ＆　付録　バイオインフォマティクス理解のためのデータベース、 浅島誠・黒岩常祥・小原雄治編、 現代生物科学入門１　ゲノム科学の基礎 岩波書店. 201-255 (2009) ISBN978-4-00-006961-8 C3345.
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中井謙太、 ゲノム配列情報解析の課題と未来について、 Science Portal China（中国科学技術月報）,
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Last update: May 2, 2011