使われているソフトウェア ====================================== .. csv-table:: :header: ソフトウェア名, バージョン, 使い方 :widths: 7, 7, 7 bcftools, bcftools=1.12=h45bccc9_1, conda nextflow, nextflow=20.10.0=h4a94de4_1, conda snpEff, snpeff=5.0=hdfd78af_1, conda pangolin, pangolin==2.4.2, conda pangolearn, pangolearn==2021-04-28, conda samtools, 1.9, SHIROKANE の moduleコマンド bwa, 0.7.17-r1188, SHIROKANE の moduleコマンド biobambam, 0.0.191, パス指定 trimmomatic, 0.39, パス指定 GenomonFisher, 0.2.0, パス指定