情報処理学会第79回全国大会学生奨励賞受賞

我々との共同研究による以下の発表で、発表された 佐々木耀一氏（北海道大学）が情報処理学会より学生奨励賞を受賞されました。おめでとうございます。（２０１７年）

• 佐々木耀一，渋谷 哲朗，大森亮介，伊藤公人，有村博紀，正規化ハミング距離を用いた三次元点集合マッチングの高速化とインフルエンザウイルス解析への応用，情報処理学会、第79回全国大会、7ZB-01，2017年3月16日-18日，名古屋，日本．

東京大学工学教程・情報工学「アルゴリズム」出版

丸善出版株式会社より、以下の書籍が出版されました。（丸善出版ニュース）（Amazon)

• 渋谷 哲朗，アルゴリズム，東京大学工学教程・情報工学，東京大学工学教程編纂委員会（編），丸善出版、2016年11月20日発行．

情報処理学会2016年度山下記念賞受賞

我々との共同研究による以下の発表で、発表された 佐々木耀一氏（北海道大学）が情報処理学会より山下記念賞を受賞されました。おめでとうございます。なお、佐々木氏の同発表はバイオ情報学研究会学生奨励賞も同時に受賞されています。（２０１６年）

• 佐々木 耀一，渋谷 哲朗，伊藤 公人，有村 博紀， "三次元空間における効率良い近似点集合マッチングと分子パターン照合への応用"，第 42 回バイオ情報学(BIO)研究会，2015年．

情報処理学会2015年バイオ情報学研究会学生奨励賞受賞

我々との共同研究による以下の発表で、発表された 佐々木耀一氏（北海道大学）が情報処理学会バイオ情報学研究会より学生奨励賞を受賞されました。おめでとうございます。（２０１６年）

• 佐々木 耀一，渋谷 哲朗，伊藤 公人，有村 博紀， "三次元空間における効率良い近似点集合マッチングと分子パターン照合への応用"，第 42 回バイオ情報学(BIO)研究会，2015年．

情報処理学会2014年バイオ情報学研究会功労賞受賞

情報処理学会バイオ情報学研究会および同学会Transactions on Bioinformatics誌におけるこれまでの学会・学会誌活動を評価していただきました。（２０１４年１２月１８日）

日本薬学会2012年度構造活性相関シンポジウム優秀発表賞受賞

我々との共同研究による以下の発表で、発表された寺師玄記氏（北里大学）が日本薬学会より優秀発表賞を受賞されました。おめでとうございます。（日本薬学会構造活性相関部会・ニュースレター SAR News No, 24)（２０１２年１２月）

• 寺師玄記，渋谷哲朗，竹田−志鷹真由子，「タンパク質立体構造データベースに対する高速類似部分構造検索法の開発」，日本薬学会構造活性相関部会第40回構造活性相関シンポジウム，2012年．

Nature Genetics掲載

肝がん患者２７名のゲノムを解析した論文がNature Geneticsに掲載されました。（２０１２年５月）

• Akihiro Fujimoto, Yasushi Totoki, Tetsuo Abe, Keith A Boroevich, Fumie Hosoda, Ha Hai Nguyen, Masayuki Aoki, Naoya Hoshono, Michiaki Kubo, Fuyuki Miya, Yasuhito Arai, Hiroyuki Takahashi, Takuya Shirakihara, Masao Nagasaki, Tetsuo Shibuya, Kaoru Nakano, Kumiko Watanabe-Makino, Hiroko Tanaka, Hiromi Nakamura, Jun Kusuda, Hidenori Ojima, Kazuaki Shimada, Takuji Okusaka, Masaki Ueno, Yoshinobu Shigekawa, Yoshiiku Kawakami, Koji Arihiro, Hideki Ohdan, Kunihito Gotoh, Osamu Ishikawa, Shun-ichi Ariizumi, Masakazu Yamamoto, Terumasa Yamada, Kazuaki Chayama, Tomoo Kosuge, Hiroki Yamaue, Naoyuki Kamatani, Satoru Miyano, Hitoshi Nakagama, Yusuke Nakamura, Tatsuhiko Tsunoda, Tatsuhiro Shibata, and Hidewaki Nakagawa. Whole Genome Sequencing of Liver Cancers Identifies Etiological Influences on Mutation Patterns and Recurrent Mutations in Chromatin Regulators. Nature Genetics, 2012.doi: 10.1038/ng.2291

マイクロソフトリサーチ日本情報学研究賞受賞

マイクロソフト（株）より、第３回マイクロソフトリサーチ日本情報学研究賞を受賞しました。(In English、医科学研究所関連ページ） （２０１１年１１月１５日）

船井学術賞受賞

船井情報科学振興財団より第10回船井学術賞を受賞しました。（医科学研究所関連ページ）　（２０１１年５月２８日）

Nature Genetics掲載

日本人の個人ゲノムを世界で初めて解読した論文がNature Geneticsに掲載されました。次世代シークエンサーを用いて配列解読を行い、ヒトゲノム解析センターのスパコンを用いて結果を解析しました。

• Akihiro Fujimoto, Hidewaki Nakagawa, Naoya Hosono, Kaoru Nakano, Tetsuo Abe, Keith A Boroevich, Masao Nagasaki, Rui Yamaguchi, Tetsuo Shibuya, Michiaki Kubo, Satoru Miyano, Yusuke Nakamura, and Tatsuhiko Tsunoda. Whole-genome Sequencing and Comprehensive Variant Analysis of a Japanese Individual Using Massively Parallel Sequencing, Nature Genetics, Vol. 42, pp. 931-936, 2010.

J. ACM 掲載

渋谷が提案した、タンパク質立体構造（およびそれに類似した高次元データ）のための全く新しい索引構造「幾何的接尾辞木」(geometric suffix tree)についての論文が情報科学のトップジャーナルであるJournal of the ACMに掲載されました。

• Tetsuo Shibuya, Geometric Suffix Tree: Indexing Protein 3-D Structures, Journal of the ACM, Vol. 57, No. 3, Article No.15, pp. 1-17, 2010.

RECOMB Best Paper Award 受賞

2009年5月18〜21日に米国アリゾナ州ツーソンにて開催された、バイオインフォマティクスのトップカンファレンスである国際会議RECOMBにおいて、2009年のBest Paper Award(単独）に以下の論文が選ばれました。この論文では、タンパク質立体構造検索に対する新しいアルゴリズム設計パラダイムを提案し、それによってこれまで不可能と考えられていたタンパク質立体構造の高速線形時間検索アルゴリズムを実現しました。このアルゴリズムは、単に従来アルゴリズムより理論計算量が優れているだけでなく、実際にもＰＤＢ上において精度の犠牲なく従来と比べ数倍〜数十倍高速な検索を実現しています。（関連ページ： SMAD (Statistical Model-based Algorithm Design)）

• Tetsuo Shibuya, Searching Protein 3-D Structures in Linear Time, Proc. 13th Annual International Conference on Research in Computational Molecular Biology (RECOMB 2009), 2009 LNBI 5541, pp 1-15.　(PDF file)

山下記念賞受賞

タンパク質のヒンジ構造検出アルゴリズムの研究が、情報処理学会より平成20年度情報処理学会山下記念賞を受賞しました。（平成２１年３月１１日）

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