氏名

渋谷 哲朗 （しぶや てつお）

学位

博士（理学）、東京大学大学院理学系研究科、平成１４年１２月９日

履歴

兼任

理化学研究所共同研究員 (平成１３年４月〜平成１６年３月)
理化学研究所客員研究員 (平成１６年４月〜平成20年３月)
京都大学化学研究所バイオインフォマティクスセンター　客員准教授 (平成２５年４月〜平成２６年３月)
学習院大学理学部　客員教授（令和4年4月〜令和7年3月）

受賞

平成20年度情報処理学会山下記念賞，情報処理学会，平成２１年３月１１日．
Best Paper Award, The 13th Annual International Conference on Research in Computational Molecular Biology (RECOMB 2009, Tucson, Arizona, United States), May 21, 2009.
第10回船井学術賞，船井情報科学振興財団．平成２３年５月２８日．
第３回マイクロソフトリサーチ日本情報学研究賞，マイクロソフト株式会社，平成２３年１１月１５日．
２０１４年情報処理学会バイオ情報学研究会功労賞，情報処理学会，平成２６年１２月１８日．
令和３年度文部科学大臣表彰，科学技術賞，令和3年4月14日．
IEEE Outstanding Paper Award, The 21st IEEE International Conference on Trust, Security and Privacy in Computing and Communications (IEEE TrustCom 2022), December 9-11, 2022.

共著者の受賞

2012年度構造活性相関シンポジウム優秀発表賞，「タンパク質立体構造データベースに対する高速類似部分構造検索法の開発」，寺師玄記，渋谷哲朗，武田-志鷹真由子（発表者の寺師玄記氏が受賞），日本薬学会，平成24年11月30日．
2015年バイオ情報学研究会学生奨励賞，「三次元空間における効率良い近似点集合マッチングと分子パターン照合への応用」，佐々木 耀一，渋谷 哲朗，伊藤 公人，有村 博紀（発表者の佐々木 耀一氏が受賞），情報処理学会バイオ情報学研究会．
2016年度情報処理学会山下記念賞，「三次元空間における効率良い近似点集合マッチングと分子パターン照合への応用」，佐々木 耀一，渋谷 哲朗，伊藤 公人，有村 博紀（発表者の佐々木 耀一氏が受賞），情報処理学会，2017年3月16日．
2017年情報処理学会全国大会学生奨励賞，「正規化ハミング距離を用いた三次元点集合マッチングの高速化とインフルエンザウイルス解析への応用」，佐々木耀一，渋谷 哲朗，大森亮介，伊藤公人，有村博紀，（発表者の佐々木 耀一氏が受賞），情報処理学会，2017年3月16日
Best Oral Presentation Award, The 4th International Conference on Computing and Big Data, 2021. (発表者のArda Akdemir氏が受賞)
優秀プレゼンテーション賞, 情報処理学会バイオ情報学研究会, 2021 (発表者の山本章人氏が受賞)

その他の顕彰

シニア会員、情報処理学会、2017年

国際会議プログラム委員長等

Program co-Chair, The 7th IAPR Conference on Pattern Recognition in Bioinformatics (PRIB 2012), 2012.
Program co-Chair, The 25th Genome Informatics Workshop (GIW 2014), 2014.
Local co-Chair, The 9th International Conference on Similarity Search and Applications (SISAP 2016), 2016
Program co-Chair, The 14th International Conference on Biomedical Engineering and Technology (ICBET 2024), June 14-17, 2024, Seoul, South Korea.
Program Chair, The 11th International Conference on Biomedical and Bioinformatics Engineering (ICBBE 2024), November 8-11, 2024, Kyoto, Japan.

学術誌編集長等

IPSJ Transactions on Bioinformatics, 編集副委員長(2007/4-2010/3, 2016/4-2020/3)
IPSJ Transactions on Bioinformatics, 編集委員長(2010/4-2012/3)

研究会主査等

情報処理学会バイオ情報学研究会、主査 (2011/4-2013/3)

国際会議プログラム委員等

Program Committee Member, The 15th International Conference on Genome Informatics (GIW 2004)
Scientific Committee Member, The IADIS Virtual Multi Conference on Computer Science and Information Systems (MCCIS 2005)
Program Committee Member, Workshop on Algorithms and Computation 2005.
Program Committee Member, The 16h International Conference on Genome Informatics (GIW 2005), 19-21 December, 2005.
Program Committee Member, Workshop of Data Mining in Bioinformatics, 2006.
Program Committee Member, The 17h International Conference on Genome Informatics (GIW 2006), 19-21 December, 2006.
Program Committee Member, The 3rd Indian International Conference on Artificial Intelligence (IICAI-07) , 2007.
Program Committee Member, The 18h International Conference on Genome Informatics (GIW 2007), 19-21 December, 2007.
Program Committee Member, The 2nd VLDB Bioinformatics Conference, 2007.
Program Committee Member, The 2007 Annual Conference of Japanese Society for Bioinformatics, 2007.
Program Committee Member, The 19h International Conference on Genome Informatics (GIW 2008), 2008.
Program Committee Member, The 4th Indian International Conference on Artificial Intelligence (IICAI-09) , 2009.
Program Committee Member, The 20h International Conference on Genome Informatics (GIW 2009), 2009
Program Committee Member, The 5th International Conference on Future Information Technology (FutureTech 2010), 2010.
Program Committee Member, The 9th International Conference on Bioinformatics (InCoB 2010), 2010.
Program Committee Member, The 21th International Conference on Genome Informatics (GIW 2010), 2010.
Program Committee Member, The 5th Workshop on Algorithms and Computation (WALCOM 2011), 2011.
Program Committee Member, The 6th International Conference on Future Information Technology (FutureTech 2011), 2011.
Program Committee Member, The 10th International Conference on Bioinformatics (InCoB 2011), 2011
Program Committee Member, IEEE Conference on Healthcare Informatics, Imaging and Systems Bilogy (HISB 2011), 2011.
Program Committee Member, ACM Conference on Bioinformatics, Computational Biology and Biomedicine (ACM BCB), 2011.
Program Committee Member IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM 2011), 2011.
Program Committee Member, The 22nd International Conference on Genome Informatics (GIW 2011), 2011.
Program Committee Member IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM 2012), 2012.
Program Committee Member, The 11th International Conference on Bioinformatics (InCoB 2012), 2012.
Program Committee Member, The 2nd annual IEEE International Conference on Healthcare Informatics, Imaging and Systems Biology (HISB 2012), 2012.
Program Committee Member IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM 2013), 2013.
Program Committee Member, The 12th International Conference on Bioinformatics (InCoB 2013), 2013.
Program Committee Member, The 24th International Conference on Genome Informatics (GIW 2013), 2013.
Program Committee Member, The 13th International Conference on Bioinformatics (InCoB 2014), 2014.
Program Committee Member, The 25th International Symposium on Algorithms and Computation (ISAAC 2014), 2014.
Program Committee Member IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM 2014), 2014.
Program Committee Member, The 23rd Annual Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology and the 14th European Conference on Computational Biology (ISMB/ECCB 2015), 2015.
Program Committee Member, IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM 2015), 2015.
Program Committee Member, Genomic Medicine 2015, 2015.
Program Committee Member, The 26th International Conference on Genome Informatics Workshop and the 10th International Conference on Bioinformatics Joint Conference(GIW/InCoB 2015), 2015.
Program Committee Member, IEEE The 16th International Conference on BioInformatics and BioEngineering (BIBE 2016), 2016.
Program Committee Member, The 13th International Colloquium on Theoretical Aspects of Computing (ICTAC 2016), 2016
Program Committee Member, The 27th International Conference on Genome Informatics (GIW 2016), 2016.
Program Committee Member, The 24th Annual Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB 2016), 2016.
Program Committee Member, The 15th International Conference on Bioinformatics (InCoB 2016), 2016.
Program Committee Member, The 10th International Conference on Similarity Search and Applications (SISAP 2017), 2017.
Program Committee Member, The 16th International Conference on Bioinformatics (InCoB 2017), 2017.
Program Committee Member, International Conference on Genome Informatics (GIW/BIOINFO 2017), 2017.
Program Committee Member, IEEE The 18th International Conference on BioInformatics and BioEngineering (BIBE 2018), 2018.
Program Committee Member, The 11th International Conference on Similarity Search and Applications (SISAP 2018), 2018.
Program Committee Member, The 29th International Symposium on Algorithms and Computation (ISAAC 2018), 2018.
Program Committee Member, International Conference on Genome Informatics (GIW 2018), 2018.
Program Committee Member, The 12th International Conference on Similarity Search and Applications (SISAP 2019), 2019.
Program Committee Member, International Conference on Genome Informatics (GIW 2019), 2019.
Program Committee Member, The 13th International Conference on Similarity Search and Applications (SISAP 2020), 2020.
Program Committee Member, The 16th International Conference on Bioinformatics (InCoB 2020), 2020.
Program Committee Member, The 14th International Conference on Similarity Search and Applications (SISAP 2021), 2021.
Program Committee Member, International Conference on Genome Informatics (GIW 2022), 2022.
Program Committee Member, the 16th International Conference on Similarity Search and Applications, (SISAP 2023), 2023.
Program Committee Member, The 2023 IEEE Interntaional Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM 2023), 2023.
Program Committee Member, the 17th International Conference on Similarity Search and Applications, (SISAP 2024), 2024.

学術誌編集委員等

電子情報通信学会離散数学とその応用小特集号(英文論文誌A)小特集編集委員会編集委員(2004/3-)
情報処理学会論文誌編集委員会特集企画グループ編集委員(2005/6/1-2007/5/31)
電子情報通信学会ソサイエティ論文誌査読委員（2005/11/15-2007/4)
IPSJ Transactions on Bioinformatics, 編集委員(2005/4-2007/3, 2012/4-2016/3)
IPSJ Journal of Information Processing, 編集委員(2009/6-2013/5)
情報処理学会論文誌「パズルの数理」特集号、編集委員(2011)
Dataset Papers in Bioinformatics, Editor (2012/3/14-)
情報処理学会論文誌「データベーストランザクション」編集委員(2015/4/1-2019/3/31)
Evolutionary Bioinformatics, Guest Editor (2016)
Algorithms, Editorial Board Member (2021-)

学会理事等

日本バイオインフォマティクス学会、評議員(2011/4-2012/3)
日本バイオインフォマティクス学会、理事(2012/4-2013/3, 2014/4-2018/3)

学会委員等

電子情報通信学会コンピュテーション研究会, 専門委員 (2000/4-2006/3, 2020/4-2026/3)
情報処理学会アルゴリズム研究会、運営委員 (2002/4-2004/3, 2007/4-2011/3)
情報処理学会アルゴリズム研究会、研究会幹事 (2004/4-2006/3)
日本バイオインフォマティクス学会、幹事(2004/4-2013/3)
情報処理学会バイオ情報学研究会、運営委員 (2005/4-2007/3, 2013/4-2017/3, 2018/4-2020/3)
情報処理学会バイオ情報学研究会、研究会幹事 (2007/4-2011/3)
日本バイオインフォマティクス学会　夏の学校幹事 (2007/8/6-8)
生命医薬情報学連合大会、大会プログラム委員(2012/10, 2013/10)
情報処理学会、代表会員(2012/4-2014/3)
日本バイオインフォマティクス学会、監事(2013/4-2014/3,2019/4-2020/3)
国際ゲノム会議、プログラム委員(2015)
日本学術振興会 ゲノムテクノロジー第164委員会 委員 (2014/5-)
バイオインフォマティクス技術者認定試験、委員長(2020/4-2021/3)

海外訪問研究

Assignment, IBM Watson Research Center, NY, USA(2000/7-10)
Visiting Researcher, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique(INRIA), Lille, France, (2008/2)

教育関連

東京大学大学院情報理工学系研究科コンピュータ科学専攻大学院担当（協力講座） (2004/4-現在)
東京大学大学院新領域創成科学研究科情報生命科学専攻非常勤講師 (2004/4-現在)
文部科学省科学技術振興調整費バイオインフォマティクス人材養成プログラム「ゲノム情報科学研究教育機構」講師 (2004/4-2007/3)
財団法人神奈川県科学アカデミー「バイオインフォマティクスコース」講師(2005/1)
東京大学理学部情報科学科非常勤講師(2005/4-現在)
京都大学大学院薬学研究科非常勤講師 (2007/4-2009/3, 20010/4-2011/3)
中央大学理工学部物理学科非常勤講師（2008/4-2009/3)
創価大学生命情報工学科非常勤講師(2008/4-2010/3)
東京工業大学ＧＣＯE「計算世界観の深化と展開」第3回秋の学校、講師(2010/9/1-3)
東京大学理学部生物情報科学科非常勤講師(2016/4-2017/3)

研究費等

研究代表者

文部科学省科学研究費補助金，若手研究（Ｂ），課題番号２０７００２６４，研究代表者，「タンパク質３次元構造データベースに対する高速かつ柔軟な検索手法とその応用」，4,290千円（うち直接経費3,300千円），平成２０年度〜平成２２年度．
財団法人大川情報通信基金２００９年度研究助成，09-07，研究代表者，「タンパク質立体構造データベース検索システムの研究開発」，1,000千円，平成２２年度．
文部科学省科学研究費補助金，基盤研究（Ｂ），課題番号２５２８０００２，研究代表者，エフォート：35%，「ＳＭＡＤによるビッグデータ類似検索超高速化とその応用」，10,400千円（うち直接経費8,000千円），平成２５年度〜平成２８年度．
文部科学省科学研究費補助金，基盤研究（Ｂ），課題番号17H01693，研究代表者，エフォート：30%，「ビッグクエリー×ビッグデータ検索実現のためのＳＭＡＤ技術の新展開」，11,570千円（うち直接経費8,900千円），平成２９年度〜平成３２年度．
文部科学省科学研究費補助金，挑戦的研究（萌芽），課題番号17K20023，研究代表者，エフォート：20%，「家族性疾患解析のパラダイムシフトへ向けた全国民全ゲノム規模血縁推定基盤技術の開拓」，6,240千円（うち直接経費4,800千円），平成２９年度〜平成３１年度．
文部科学省科学研究費補助金，挑戦的研究（萌芽），課題番号20K21827，「グラフ匿名化による大規模個人ゲノムデータベースの安全で効率的な検索技術の開拓」、6,240千円（うち直接経費4,800千円），令和２年度〜令和４年度．
文部科学省科学研究費補助金，基盤研究（Ｂ），23H03345，エフォート：20%，「情報量最適な大規模データ差分プライバシー技術の開発」，16,770千円(直接経費12,900千円），2023年度〜2027年度．
文部科学省科学研究費補助金，挑戦的研究（萌芽），23K18501，エフォート：15%，「大規模家系データを活用した個人医療の実現のための差分プライバシー保護技術の開拓」，6,240千円(直接経費4,800千円），2023年度〜2025年度．

研究分担者等（主に分担金等のあるもの）

文部科学省科学研究費補助金，基盤（Ａ），課題番号２３２４００２，研究分担者，エフォート：20%，「メニーコア環境での汎用計算モデル開発」，4,940千円（分担金（当初計画）・うち直接経費3,800千円），平成２３年度〜平成２６年度，（研究代表者：定兼邦彦，国立情報学研究所）．
文部科学省科学研究費補助金，新学術領域研究(研究領域提案型)，研究課題番号：２４１０６００７，研究分担者，エフォート：15%（平成26年度迄）、5%（平成27年度以降），「計算限界解析法から革新的データ構造化技術への展開」，5,850千円（分担金（当初計画）・うち直接経費4,500千円），平成２４年度〜平成２８年度，（研究代表者：徳山豪，東北大学）．（新学術領域，課題番号：２４１０６００１，「多面的アプローチの統合による計算限界の解明」，（領域代表者：渡辺治，東京工業大学），計画研究）
CREST，主たる共同研究者，当初エフォート：20%，「ビッグデータ時代に向けた革新的アルゴリズム基盤」，75,000千円（分担直接経費（当初計画）），平成26年度（10月〜）〜令和3年度(9月)，（研究代表者：加藤直樹，京都大学，全体研究費300,000千円）　課題番号 JPMJCR1402JST
文部科学省科学研究費補助金，学術変革領域研究（Ａ），エフォート：10%，「アルゴリズム基礎理論の追究・発展」，2020年度〜2024年度，（研究代表者：牧野和久，京都大学）．課題番号　20H05967
文部科学省科学研究費補助金，基盤研究（S)，エフォート：15%，「圧縮秘匿計算による大規模データ処理」，2021年度〜2025年度，（研究代表者：定兼邦彦）　課題番号　21H05052
日本医療研究開発機構、「全ゲノム情報を患者に還元するためのゲノム・臨床情報基盤の研究」、井元清哉、2021年度〜2022年度、革新的がん医療実用化研究事業、1-14。
厚生労働科学研究費補助金（政策科学総合研究事業（臨床研究等ICT基盤構築・人工知能実装研究事業），「大規模データの利活用研究の加速のための研究」，2021年度〜2022年度，木村英善，課題番号 21AC1001、エフォート5%．

研究協力者・連携研究者等（分担金等のないもの）

ERATO河原林巨大グラフプロジェクト，協力研究者，平成２４年度〜平成２９年度，（研究総括：河原林健一，国立情報学研究所）．
文部科学省「ビッグデータ利活用のためのシステム研究等」委託業務，「ビッグデータ利活用のためのデータ連携技術に関するフィージビリティスタディ及び予備研究」，課題４（超大規模データ分析・リアルタイムマイニングアルゴリズム），研究協力者，平成２５年度（１０月〜３月），（事業代表者：北川博之，筑波大学）．
科学技術振興機構，戦略的創造研究推進事業，特定課題調査「ビッグデータ時代に向けた革新的アルゴリズム基盤」，調査参加者，平成２５年度，（研究代表者：加藤直樹，京都大学）．（ＣＲＥＳＴ・さきがけ複合領域「ビッグデータ統合利活用のための次世代基盤技術の創出・体系化」，研究統括：喜連川 優，国立情報学研究所）
文部科学省科学研究費補助金，基盤研究（S)，研究協力者，「高階モデル検査の深化と発展」，平成２７年度〜平成３１年度，（研究代表者：小林直樹，東京大学）．

所属学会

情報処理学会
電子情報通信学会
日本バイオインフォマティクス学会
日本癌学会
バイオインフォマティクス・ジャパン
ゲノムテクノロジー研究会（旧164委員会）

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