Others
Invited talks, committees, teaching, and other activities outside research.
Invited talks2
- 2025/12/18Sakai SA, Vandenbon A. Getting to know, learning, and using spatial transcriptomics. AJACS data-analysis workshop, National Bioscience Database Center (NBDC), Japan Science and Technology Agency (materials, video (TogoTV); in Japanese)
- 2025/3/2Sakai SA. JSPS Research Fellowship seminar: my own experience (n = 1) and what comes next. Joint JSPS fellowship seminar of eight young researchers' associations, online (link; in Japanese)
Committeessociety and meeting organization
- 2024 –Board member, Young Researchers' Association for Bioinformatics (Seimei-joho-kagaku Wakate no Kai) (link)
- 2023Program committee member, IIBMP2023 (12th Joint Conference on Informatics in Biology, Medicine and Pharmacology) (link)
- Chair and organizer, EPOC human-resource development seminars, National Cancer Center
Articlesnewsletters and press
- 2026/1Ohira M, Kurihara K, Sakai SA, Tahara Y, Minei R. Report on the young researchers' session “Bioinformatics Research Collaboration Guild”. Newsletter of the Japanese Society for Bioinformatics, 48:14-16 (in Japanese)
Teachingteaching assistant
- 2023/12/22Teaching assistant, UTokyo DSTEP Drug-Discovery Data Science Practicum @NCC EPOC
- 2023/12/15Teaching assistant, UTokyo DSTEP Drug-Discovery Data Science Practicum @IMSUT
- 2023/9/2 –Teaching assistant, Data Science Human Resource Development Seminar, National Cancer Center Hospital East
- 2023/1/10 – 3/28Teaching assistant, Cancer Informatics Seminar: AI / machine learning boot camp for beginners, National Cancer Center Hospital East (link)
- 2022/12/9Teaching assistant, UTokyo DSTEP Drug-Discovery Data Science Practicum (online) (DSTEP)
Journal clubBI seminar @National Cancer Center
Chapters I presented in the lab's reading group (Japanese textbooks; titles in Japanese).

全ゲノム・エクソーム遺伝統計解析〜Python,Rで実践して身につく,未知の遺伝要因の探索と疾患リスク予測
- 2024/6/15第4章 原因/リスク遺伝子同定後の解析 (1, 2節)
- 2024/4/20第1章 NGS解析 〜バリアント検出

実践Data Scienceシリーズ Rではじめる地理空間データの統計解析入門
- 2024/3/15第5部〈応用編〉 非ガウス空間データの統計モデリング

Pythonで実践 生命科学データの機械学習〜あなたのPCで最先端論文の解析レシピを体得できる!
- 2024/1/27第12章 発展編(1):機械学習を用いたアプタマー配列の解析と創薬
- 2023/11/25第8章 実践編(3):シングルセル解析とVAE

物体・画像認識と時系列データ処理入門 [TensorFlow2/PyTorch対応第2版]
- 2023/7/29第9章 ジェネレーティブディープラーニング
- 2023/7/9第7章 一般物体認識のためのディープラーニング
- 2023/5/20第4章 ニューラルネットワークの可動部(勾配ベースの最適化)

バイオインフォマティクス: web連携テキスト基礎から応用
- 2023/4/8第7章 フィールドのバイオインフォマティクス

Python機械学習プログラミング 達人データサイエンティストによる理論と実践
- 2022/11/19第18章 複雑な環境での意思決定−強化学習
- 2022/10/29第16章 系列データのモデル化−リカレントニューラルネットワーク
- 2022/10/1第13章 ニューラルネットワークの訓練をTensorflowで並列化する
- 2022/7/16第10章 回帰分析−連続値をとる目的変数の予測
- 2022/6/18第7章 アンサンブル学習−異なるモデルの組み合わせ

Pythonで学ぶアルゴリズムの教科書
- 2022/2/19Chapter7 さまざまなアルゴリズムを学ぶ
- 2022/1/22Chapter3 データ構造を学ぶ

Rによる多変量解析入門
- 2021/12/18第14章 データが持つ情報を可視化したい−パッケージggplot2による描画
- 2021/11/13第12章 似たもの同士にグループ分けしたい−クラスター分析