使われているソフトウェア¶
ソフトウェア名 |
バージョン |
使い方 |
|---|---|---|
bcftools |
bcftools=1.12=h45bccc9_1 |
conda |
nextflow |
nextflow=20.10.0=h4a94de4_1 |
conda |
snpEff |
snpeff=5.0=hdfd78af_1 |
conda |
pangolin |
pangolin==2.4.2 |
conda |
pangolearn |
pangolearn==2021-04-28 |
conda |
samtools |
1.9 |
SHIROKANE の moduleコマンド |
bwa |
0.7.17-r1188 |
SHIROKANE の moduleコマンド |
biobambam |
0.0.191 |
パス指定 |
trimmomatic |
0.39 |
パス指定 |
GenomonFisher |
0.2.0 |
パス指定 |