使われているソフトウェア

ソフトウェア名

バージョン

使い方

bcftools

bcftools=1.12=h45bccc9_1

conda

nextflow

nextflow=20.10.0=h4a94de4_1

conda

snpEff

snpeff=5.0=hdfd78af_1

conda

pangolin

pangolin==2.4.2

conda

pangolearn

pangolearn==2021-04-28

conda

samtools

1.9

SHIROKANE の moduleコマンド

bwa

0.7.17-r1188

SHIROKANE の moduleコマンド

biobambam

0.0.191

パス指定

trimmomatic

0.39

パス指定

GenomonFisher

0.2.0

パス指定