Genomon

Genomonはがんゲノムシークエンス解析のためのパイプラインです。

( https://genomon.readthedocs.io/ja/latest/index.html )

このパイプラインでは生成したbamファイルをもとにGenomonを実行します。

解析結果はmutation, svのフォルダに入っています。

Genomonの解析結果については https://genomon.readthedocs.io/ja/latest/dna_output_info.html を参考にしてください。

Note

Genomonのコンテナ化

Genomon Mutation(controlpanelなし), Genomon SV(controlpanelなし),

pmsignature, GenomonPostAnalysis, paplotのイメージファイルを作成し、

nextflow上で実行できるようになっています。