CaGMeJ
CaGMeJ(Cancer Genomic Medicine in Japan)はWGS解析パイプラインです。
Parabricksを使うことでGPUによる高速なゲノム解析を可能とします。
Parabricksについては https://docs.nvidia.com/clara/parabricks/v3.5/index.html を参考にしてください。
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Users Guide ( RNA )
Parabricks ( DNA )
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